植物病原性Rhizobium属（旧Agrobacterium属）推奨菌株

根頭がんしゅ病菌や毛根病菌が含まれているAgrobacterium属では、病原性に基づいて人為的に属と種が定義されてきた。また、その種内には、変種レベルの分類階級である複数のbiovar（生理型）が設けられてきた。しかし、近年になって導入された多相分類学的研究の成果に基づき、Agrobacterium属とRhizobium属とを1つに統合して「Rhizobium属」とすることと、各biovarを種レベルの分類群へと格上げすることが提案された。このような植物病原性Rhizobium属細菌（=旧Agrobacterium属細菌）をめぐる分類体系の変更に対応するために、16S rDNA、atpD、glnA、recAに基づいた分子系統解析、接種試験、PCR検定などを実施し、その結果に基づいてジーンバンク所蔵菌株の再同定を行った。そして、菌種/病原性タイプ/genomovarごとに可能な限り典型的と思われる菌株を選び出し、「推奨菌株（分類・同定試験用の対照菌株）」としてまとめた。さらに、分離源植物ごとに、代表的な病原性菌株（TiあるいはRiプラスミド保有菌）を「推奨菌株（接種試験用の対照菌株）」として選定した。

• スペシャルセレクション

• 文献 澤田宏之・瀧川雄一・牧野孝宏 (2015). 根頭がんしゅ病菌・毛根病菌における最新学名への読み替え. 植物防疫 69(2): 106-112. [jppa.or.jp]
• 文献 澤田宏之・山﨑福容・竹谷勝・青木孝之 (2014). Rhizobium属細菌の分類の変遷とジーンバンクにおける対応. 日本微生物資源学会誌 30(1): 13-27. [jsmrs.jp]
• 文献 澤田宏之 (2006). いわゆる「アグロバクテリウム」について─ (1) プロフィールの紹介─. 日本微生物資源学会誌 22(2): 117-121. [jsmrs.jp]
• 文献 澤田宏之 (2007). いわゆる「アグロバクテリウム」について─ (2) 分類の現状─. 日本微生物資源学会誌 23(1): 29-34. [jsmrs.jp]
• 文献 澤田宏之・富岡啓介・永井利郎・青木孝之・遠藤眞智子・廣岡裕吏・佐藤豊三 (2007). いわゆる「アグロバクテリウム」について─ (3) 今後の分類を考えるための視点─. 日本微生物資源学会誌 23(2): 95-99. [jsmrs.jp]

• *1 分類学的な所属が確定できた所蔵菌株の中から、各分類群（菌種/病原性タイプ/genomovar）ごとに代表的な菌株を選び、関連情報とともに示しました。
• *2 genomovarとはR. radiobacter内の変種レベルの分類階級です。

• *1 TiあるいはRiプラスミドを保持しており、病原性を有していることが確認できた所蔵菌株の中から、分離源植物ごとに代表的な菌株を選び、関連情報とともに示しました。
• *2 1つの分離源植物からR. radiobacter (Ti)とR. rhizogenes (Ti)の両方が分離されている場合は、そのいずれからも推奨菌株が選んであります。