【論文紹介】日本のコムギコアコレクションに1塩基多型3万個を追加

日本のコムギコアコレクション

ジーンバンクでは、保存しているコムギ遺伝資源の来歴情報から選定した国内のコムギ95品種に標準品種を加えた計96品種を「日本のコムギコアコレクション (JWC)」として提供しています。

JWCのDNAマーカー情報はこれまでにもありましたが、このたび、農研機構と京都府立大の研究グループが新たにゲノム全体の情報から作出した1塩基多型(SNP)3万個を報告しました (Mizuno et al., 2024)。この結果、マッピングできたSNP数は2,975から30,217個に増え、より詳細な遺伝解析ができるようになりました。これらSNPを含めたJWCの多型情報は、ゲノムブラウザTasuke+から確認できます。

コムギにおいて、目的形質と関連性の高いゲノム領域を特定するGWAS解析や、育種目的等で特定の遺伝子近くのDNAマーカーを開発する際には、JWCとSNP情報をセットでご活用ください。 ()