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キウイフルーツかいよう病菌 (Pseudomonas syringae pv. actinidiae) 推奨菌株

キウイフルーツかいよう病はわが国をはじめとする多くのキウイフルーツ生産国で大きな被害を与えており、深刻な問題となっている。その病原細菌 (Pseudomonas syringae pv. actinidiae) は現在、表現型・遺伝型の違いに基づいて5つの生理型 (biovar 1, 2, 3, 5, 6) に類別されている。また、biovar間で病原性関連遺伝子のレパートリーや病原力が異なることも明らかになりつつある。なお、わが国では、このうちの4つ (biovar 1, 3, 5, 6) が確認されており、Actinidia chinensis、A. deliciosa、A. arguta等にかいよう病を引き起こしている。

文献:
Sawada, H and Fujikawa, T. (2019) Genetic diversity of Pseudomonas syringae pv. actinidiae, pathogen of kiwifruit bacterial canker. Plant Pathology 68: 1235-1248.
澤田宏之・藤川貴史 (2019) キウイフルーツかいよう病菌（Pseudomonas syringae pv. actinidiae,）における遺伝的多様性. 日本植物病理学会報 85: 3-17.
Fujikawa, T and Sawada, H (2019) Genome analysis of Pseudomonas syringae pv. actinidiae biovar 6, which produces the phytotoxins, phaseolotoxin and coronatine. Sci. Rep. 9: 3836.
Fujikawa, T and Sawada, H (2016) Genome analysis of the kiwifruit canker pathogen Pseudomonas syringae pv. actinidiae biovar 5. Sci. Rep. 6: 21399.
Genka, H, Baba, T, Tsuda, M, Kanaya, S, Mori, H, Yoshida, T, Noguchi, MT, Tsuchiya, K and Sawada, H. (2006) Comparative analysis of argK-tox clusters and their flanking regions in phaseolotoxin-producing Pseudomonas syringae pathovars. J. Mol. Evol. 63: 401-414.
Sawada, H, Takeuchi, T and Matsuda, I. (1997) Comparative analysis of Pseudomonas syringae pv. actinidiae and pv. phaseolicola based on phaseolotoxin-resistant ornithine carbamoyltransferase gene (argK) and 16S-23S rRNA intergenic spacer sequences. Appl. Environ. Microbiol. 63: 282-288.
キウイフルーツかいよう病菌 (Pseudomonas syringae pv. actinidiae）推奨菌株
MAFF番号biovartox island
の存否*1		ファゼオロ
トキシン産生*2		コロナチン
遺伝子の存否*3		Pac_ICE1,2,3
の存否*4		遺伝子領域ゲノム配列配布
211985biovar 1++--16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDSMHD00000000申込
302145biovar 1++--16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDJAAEYG000000000申込
613024biovar 1++--16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDJAAEYH000000000申込
302133biovar 1++--16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDJAAEYI000000000申込
211981biovar 1+---16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDJAAEYJ000000000申込
211983biovar 1+---16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDJAAEYF000000000申込
302091biovar 1+---16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDJAAEYK000000000申込
613017biovar 1----16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDJAAEYL000000000申込
613018biovar 1----16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDJAAEYM000000000申込
212324biovar 1----16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDJAAEYN000000000申込
212101biovar 3---Pac_ICE116S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDPGSP00000000申込
212104biovar 3---Pac_ICE116S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDPGSX00000000申込
212109biovar 3---Pac_ICE116S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDPGSS00000000申込
212145biovar 3---Pac_ICE116S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDPGSV00000000申込
212357biovar 3---Pac_ICE116S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDPGSZ00000000申込
212115biovar 3----16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDPGSO00000000申込
212118biovar 3----16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDPHQZ00000000申込
212056biovar 5----16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDBBWG00000000申込
212061biovar 5----16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDNKQU00000000申込
212054biovar 5----16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDPESZ00000000申込
212057biovar 5----16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDJAAEYO000000000申込
212063biovar 5----16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDCP024712 CP024713 CP024714申込
212134biovar 6+++-16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDMSBW00000000申込
212141biovar 6+++-16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDMSBX00000000申込
212133biovar 6+++-16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDPVZI00000000申込
212137biovar 6+++-16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDPVZJ00000000申込
212138biovar 6+++-16S acnB cts gapA gyrB pfk pgi rpoDPVZL00000000申込
  • *1 tox island 〔ファゼオロトキシン生合成遺伝子群 (argK-tox cluster) を含むゲノミックアイランド〕 の存否は、argK, argD, desI, amtAを標的としたPCR検定、および、ゲノム解析によって調査しました。
  • *2 ファゼオロトキシンの産生は、感受性の大腸菌に対する生育阻害活性を指標とした生物検定法を用いて調査しました。
  • *3 コロナチン生合成遺伝子クラスターの存否は、cfl, corR, cmaUを標的としたPCR検定、および、ゲノム解析によって調査しました。
  • *4 Pac_ICE1、Pac_ICE2、Pac_ICE3の存否は、これらの内部領域を標的としたPCR検定、および、ゲノム解析によって調査しました。